Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDSNQ15517 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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