Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NKX1-1Q15270 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKX1-1Q15270 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NKX1-1Q15270 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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