Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRP1BQ14684 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRP1BQ14684 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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