Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSHL1Q14406 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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