Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNTB1Q13884 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms