Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP1Q13835 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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