Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTAN1Q13813 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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