Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ITGA9Q13797 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms