Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX3Q13761 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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