Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TUBA3CQ13748 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TUBA3CQ13748 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TUBA3CQ13748 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA3CQ13748 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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