Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTCH1Q13635 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
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