Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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