Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf61Q13536 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms