Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRQ13535 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRQ13535 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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