Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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MTM1Q13496 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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MTM1Q13496 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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MTM1Q13496 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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MTM1Q13496 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTM1Q13496 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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MTM1Q13496 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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MTM1Q13496 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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MTM1Q13496 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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MTM1Q13496 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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MTM1Q13496 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTM1Q13496 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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