Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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