Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERCC8Q13216 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ERCC8Q13216 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ERCC8Q13216 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERCC8Q13216 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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