Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1H3Q13133 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1H3Q13133 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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