Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECH1Q13011 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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