Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BNIP1Q12981 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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