Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TWF1Q12792 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TWF1Q12792 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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