Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YJL169WYJL169W 369 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 AIM36YMR157C 768 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 ESC2YDR363W 1371 nt0.86□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 RNP1YLL046C 750 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 PUF4YGL014W 2667 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 CCL1YPR025C 1182 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 MON1YGL124C 1935 nt0.85□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 SPO74YGL170C 1242 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 FCF2YLR051C 654 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 PRM4YPL156C 855 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-GR3Q12316 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 UBC9YDL064W 474 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 MSS2YDL107W 1056 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 MFB1YDR219C 1398 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 UBP11YKR098C 2154 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 BST1YFL025C 3090 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 APC2YLR127C 2562 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 RTG3YBL103C 1461 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 AVT5YBL089W 1380 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 RRP6YOR001W 2202 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 CRD1YDL142C 852 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 DYN3YMR299C 939 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 MED8YBR193C 672 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 SEC1YDR164C 2175 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 ERV14YGL054C 417 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YKL177WYKL177W 339 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 PRK1YIL095W 2433 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 snR76snR76 109 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 FMN1YDR236C 657 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 GLC7YER133W 939 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 CPR3YML078W 549 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 CTK3YML112W 891 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YRO2YBR054W 1035 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 PPN1YDR452W 2025 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YGR273CYGR273C 525 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 SNC1YAL030W 354 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YLR379WYLR379W 375 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 ATG5YPL149W 885 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YMR31YFR049W 372 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 VTI1YMR197C 654 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 HHT2YNL031C 411 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 BAG7YOR134W 1230 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 PEX27YOR193W 1131 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 EST2YLR318W 2655 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 FUS1YCL027W 1539 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 POL4YCR014C 1749 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 VOA1YGR106C 798 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YPL238CYPL238C 390 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 YDR132CYDR132C 1488 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 AEP3YPL005W 1821 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-GR3Q12316 RPL37BYDR500C 267 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 PBP4YDL053C 558 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 BTT1YDR252W 450 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 NBL1YHR199C-A 222 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 CKA1YIL035C 1119 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 RNH202YDR279W 1053 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YLR400WYLR400W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YNR066CYNR066C 1311 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 AIM6YDL237W 1173 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 RGI2YIL057C 495 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 UBC5YDR059C 447 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 SRL1YOR247W 633 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 PUS9YDL036C 1389 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 ATP16YDL004W 483 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 ACB1YGR037C 264 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 MRPL25YGR076C 474 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 CET1YPL228W 1650 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 ESA1YOR244W 1338 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YGR190CYGR190C 366 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 SPC42YKL042W 1092 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 SRN2YLR119W 642 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 MPD1YOR288C 957 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 CDC27YBL084C 2277 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 HSE1YHL002W 1359 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 MNE1YOR350C 1992 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YLR169WYLR169W 354 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YOR203WYOR203W 354 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 YLR149CYLR149C 2193 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-GR3Q12316 CLG1YGL215W 1359 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 COG8YML071C 1824 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 PAF1YBR279W 1338 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 SHR3YDL212W 633 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 YDR018CYDR018C 1191 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 RMD5YDR255C 1266 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 LRS4YDR439W 1044 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 YLR444CYLR444C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-GR3Q12316 KAP122YGL016W 3246 nt0.71□□□□□ -2.3
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