Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 RPB2YOR151C 3675 nt3.05□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 SIZ1YDR409W 2715 nt3.05□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 SIN3YOL004W 4611 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 COX23YHR116W 456 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 RPL26AYLR344W 384 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 ABF2YMR072W 552 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 TOM70YNL121C 1854 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 CDH1YGL003C 1701 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 YAT2YER024W 2772 nt3.04□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 VHR2YER064C 1518 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 YGR237CYGR237C 2358 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 CBP2YHL038C 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 DPB11YJL090C 2295 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 PAM16YJL104W 450 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 snR42snR42 351 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 snR49snR49 165 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 MPS1YDL028C 2295 nt3.03□□□□□ -1.92
MSL5Q12186 RCY1YJL204C 2523 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SPP382YLR424W 2127 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 ELM1YKL048C 1923 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 TIF35YDR429C 825 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SDH2YLL041C 801 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPL8BYLL045C 771 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YLR458WYLR458W 381 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPB11YOL005C 363 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 IES4YOR189W 351 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SPO71YDR104C 3738 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 FRE8YLR047C 2061 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 PKH1YDR490C 2301 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 DNM1YLL001W 2274 nt3.02□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 NUP60YAR002W 1620 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 TSC11YER093C 4293 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 ADK1YDR226W 669 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YDR344CYDR344C 444 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPA34YJL148W 702 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YNL205CYNL205C 423 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 JJJ2YJL162C 1752 nt3.01□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RKM1YPL208W 1752 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 VIP1YLR410W 3441 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 APQ12YIL040W 417 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 MDM32YOR147W 1869 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SPT6YGR116W 4356 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SLP1YOR154W 1764 nt3□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RED1YLR263W 2484 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 PRK1YIL095W 2433 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 SMC2YFR031C 3513 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 DAD3YBR233W-A 285 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 COX1Q0045 1605 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 DOA4YDR069C 2781 nt2.99□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YPP1YGR198W 2454 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPA135YPR010C 3612 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 MDV1YJL112W 2145 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPL35AYDL191W 363 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 WIP1YDR374W-A 270 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 GPI14YJR013W 1212 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 TAR1YLR154W-C 375 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YNL170WYNL170W 396 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YOR050CYOR050C 348 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 MGR1YCL044C 1254 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 ARP7YPR034W 1434 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 XRN1YGL173C 4587 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YHR078WYHR078W 1659 nt2.98□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 HCS1YKL017C 2052 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 VAS1YGR094W 3315 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 DAD4YDR320C-A 219 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 RPS22BYLR367W 393 nt2.97□□□□□ -1.93 RIP-Chip
MSL5Q12186 RPL23AYBL087C 414 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 MTR4YJL050W 3222 nt2.97□□□□□ -1.93
MSL5Q12186 UBP5YER144C 2418 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 YDL062WYDL062W 426 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 AIM11YER093C-A 414 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 DLS1YJL065C 504 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 TIM8YJR135W-A 264 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 YBL065WYBL065W 345 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 HEM4YOR278W 828 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 RPN1YHR027C 2982 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 SNF12YNR023W 1701 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 STE23YLR389C 3084 nt2.96□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 OSW7YFR039C 1533 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 NAN1YPL126W 2691 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 USE1YGL098W 738 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 YLR416CYLR416C 399 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 BMS1YPL217C 3552 nt2.95□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 VPS41YDR080W 2979 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 PHO81YGR233C 3537 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 MCD1YDL003W 1701 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 YDR048CYDR048C 315 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 ESF2YNR054C 951 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 VBA4YDR119W 2307 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 CCT7YJL111W 1653 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 RRM3YHR031C 2172 nt2.94□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 RAD61YDR014W 1944 nt2.93□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 ARK1YNL020C 1917 nt2.93□□□□□ -1.94
MSL5Q12186 FAA2YER015W 2235 nt2.93□□□□□ -1.94
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