Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 GRR1YJR090C 3456 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RSM28YDR494W 1086 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 VMA7YGR020C 357 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 HYR1YIR037W 492 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 DNF3YMR162C 4971 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 FIG2YCR089W 4830 nt1.7□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SAC3YDR159W 3906 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 PKH3YDR466W 2697 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 CHC1YGL206C 4962 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SAG1YJR004C 1953 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 MRPL32YCR003W 552 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RSM18YER050C 417 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 BRP1YGL007W 378 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 PRS3YHL011C 963 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YJR023CYJR023C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 OST2YOR103C 393 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 NAN1YPL126W 2691 nt1.69□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 DAD1YDR016C 285 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 LOC1YFR001W 615 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 HOP2YGL033W 657 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 COX3Q0275 810 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 CCW14YLR390W-A 717 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 TAP42YMR028W 1101 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SFG1YOR315W 1041 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RPB5YBR154C 648 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 TRS20YBR254C 528 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 MGR1YCL044C 1254 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SPC72YAL047C 1869 nt1.68□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 NDD1YOR372C 1665 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RKM1YPL208W 1752 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SLM1YIL105C 2061 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 MYO4YAL029C 4416 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 VTC1YER072W 390 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 PEA2YER149C 1263 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 GEP7YGL057C 864 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 NOP10YHR072W-A 177 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YET1YKL065C 621 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RPF2YKR081C 1035 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YAL064WYAL064W 285 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YPL034WYPL034W 498 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SAR1YPL218W 573 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 SOK2YMR016C 2358 nt1.67□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 VPS38YLR360W 1320 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YFR057WYFR057W 456 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 EMP24YGL200C 612 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 RSM27YGR215W 333 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 IST3YIR005W 447 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YLR458WYLR458W 381 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YNL179CYNL179C 438 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 YBR174CYBR174C 315 nt1.66□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 VPS35YJL154C 2835 nt1.65□□□□□ -2.14
MSH5Q12175 IRA1YBR140C 9279 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YDR286CYDR286C 345 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 LSM7YNL147W 348 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 STB4YMR019W 2850 nt1.65□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 BFA1YJR053W 1725 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YDL009CYDL009C 324 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 SYM1YLR251W 594 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YBL108WYBL108W 306 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YPL238CYPL238C 390 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 GYP5YPL249C 2685 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 CRM1YGR218W 3255 nt1.64□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 SBE22YHR103W 2559 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YDL062WYDL062W 426 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 RIO2YNL207W 1278 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YJL016WYJL016W 1686 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 FAB1YFR019W 6837 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 RPH1YER169W 2391 nt1.63□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 PEP1YBL017C 4740 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YBP1YBR216C 2025 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 MMS22YLR320W 4365 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 RPL40AYIL148W 387 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 MRPL44YMR225C 297 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 HHT2YNL031C 411 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 VPS15YBR097W 4365 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YJR039WYJR039W 3366 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 NCS2YNL119W 1482 nt1.62□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 PAU3YCR104W 375 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 CRD1YDL142C 852 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 VPS74YDR372C 1038 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YGL230CYGL230C 444 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 SMD1YGR074W 441 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 SPC2YML055W 537 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 TFC8YPL007C 1767 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 APM3YBR288C 1452 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 YLR422WYLR422W 5799 nt1.61□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 PBP4YDL053C 558 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 RAD6YGL058W 519 nt1.6□□□□□ -2.15
MSH5Q12175 LIN1YHR156C 1023 nt1.6□□□□□ -2.15
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