Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 ASC1YMR116C 960 nt4.48□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YRM1YOR172W 2361 nt4.48□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 ARK1YNL020C 1917 nt4.47□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.47□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 YJL181WYJL181W 1836 nt4.46□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 NUP85YJR042W 2235 nt4.46□□□□□ -1.69
TFB4Q12004 VAC7YNL054W 3498 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 APC2YLR127C 2562 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 RPS27AYKL156W 249 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YPR053CYPR053C 456 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YPR092WYPR092W 306 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 CWH43YCR017C 2862 nt4.46□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 PDR5YOR153W 4536 nt4.45□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 SPI1YER150W 447 nt4.45□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YHL005CYHL005C 393 nt4.45□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 RPL38YLR325C 237 nt4.45□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 MTR10YOR160W 2919 nt4.45□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YBR184WYBR184W 1572 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 BCK2YER167W 2556 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 MUS81YDR386W 1899 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 RBK1YCR036W 1002 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 snR72snR72 98 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YER121WYER121W 345 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YGL074CYGL074C 327 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 LDS2YOL047C 1071 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.44□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 PTA1YAL043C 2358 nt4.43□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 DIS3YOL021C 3006 nt4.43□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 OM14YBR230C 405 nt4.43□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YNL034WYNL034W 1839 nt4.43□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 DPH6YLR143W 2058 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 FAA1YOR317W 2103 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 SMT3YDR510W 306 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 AIM11YER093C-A 414 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 GEP4YHR100C 558 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YIL059CYIL059C 366 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 RPS7AYOR096W 573 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 SNC2YOR327C 348 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 KIP3YGL216W 2418 nt4.42□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 CDC27YBL084C 2277 nt4.41□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 KHA1YJL094C 2622 nt4.41□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt4.41□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 URB2YJR041C 3525 nt4.41□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 RTC1YOL138C 4026 nt4.4□□□□□ -1.7
TFB4Q12004 snR74snR74 88 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 NCL1YBL024W 2055 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SPT23YKL020C 3249 nt4.4□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 DOA4YDR069C 2781 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YKL050CYKL050C 2769 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SSS1YDR086C 243 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 OLE1YGL055W 1533 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 BRO1YPL084W 2535 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 LYP1YNL268W 1836 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 EGT2YNL327W 3126 nt4.39□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 ECM5YMR176W 4236 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YDR089WYDR089W 2610 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SGF11YPL047W 300 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YPL278CYPL278C 303 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.38□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 TRK1YJL129C 3708 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 DIP2YLR129W 2832 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 RRN6YBL014C 2685 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 ERP6YGL002W 651 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YIL165CYIL165C 360 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YML007C-AYML007C-A 111 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 GCD6YDR211W 2139 nt4.37□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 NMA111YNL123W 2994 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 GYL1YMR192W 2163 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 ULI1YFR026C 510 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SEG1YMR086W 2883 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 VHS3YOR054C 2025 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 VPS54YDR027C 2670 nt4.36□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 PDR12YPL058C 4536 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YEL073CYEL073C 324 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 ISA1YLL027W 753 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YLR255CYLR255C 354 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YPR014CYPR014C 330 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 KRE5YOR336W 4098 nt4.35□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 YDR286CYDR286C 345 nt4.34□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SOD1YJR104C 465 nt4.34□□□□□ -1.71
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