Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL1Q08397 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms