Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF4Q08170 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms