Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCL1Q07820 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCL1Q07820 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms