Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt3.44□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 IRC23YOR044W 474 nt3.44□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 RPS7AYOR096W 573 nt3.44□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 TFB1YDR311W 1929 nt3.44□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 PAU14YIL176C 363 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 PAU1YJL223C 363 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 snR42snR42 351 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 FAS1YKL182W 6156 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YSP2YDR326C 4317 nt3.43□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 STE23YLR389C 3084 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YFR056CYFR056C 369 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 TIM8YJR135W-A 264 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 FCF2YLR051C 654 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YOR225WYOR225W 330 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 EGD1YPL037C 474 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YBP1YBR216C 2025 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YLR278CYLR278C 4026 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 ZDS2YML109W 2829 nt3.42□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 CDH1YGL003C 1701 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 COX1Q0045 1605 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 SEA4YBL104C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 SIP3YNL257C 3690 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 NOT5YPR072W 1683 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 Q0032Q0032 291 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 MRP8YKL142W 660 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 ISF1YMR081C 1017 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 JLP2YMR132C 627 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YPL229WYPL229W 621 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 snR191snR191 274 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 XRN1YGL173C 4587 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 TFC4YGR047C 3078 nt3.41□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 IOC3YFR013W 2364 nt3.4□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 NPR1YNL183C 2373 nt3.4□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 APC11YDL008W 498 nt3.4□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 STE14YDR410C 720 nt3.4□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YBL073WYBL073W 312 nt3.4□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 LEU3YLR451W 2661 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 MYO5YMR109W 3660 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 PAU10YDR542W 363 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 PAU11YGL261C 363 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 RPS22BYLR367W 393 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 PAU4YLR461W 363 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 TIM12YBR091C 330 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 PEX1YKL197C 3132 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 STT4YLR305C 5703 nt3.39□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 SPP382YLR424W 2127 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 FUN30YAL019W 3396 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 VPS3YDR495C 3036 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YHL005CYHL005C 393 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ESF2YNR054C 951 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YJL016WYJL016W 1686 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 PCF11YDR228C 1881 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 POL2YNL262W 6669 nt3.38□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YIL169CYIL169C 2988 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YFL063WYFL063W 456 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YIL058WYIL058W 285 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YJL015CYJL015C 285 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YPR014CYPR014C 330 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YPR077CYPR077C 372 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 SWD3YBR175W 948 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 TPS2YDR074W 2691 nt3.37□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ECM5YMR176W 4236 nt3.36□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YNL034WYNL034W 1839 nt3.36□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YGR265WYGR265W 411 nt3.36□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 DOA4YDR069C 2781 nt3.36□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 KAP95YLR347C 2586 nt3.36□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ENA2YDR039C 3276 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ENA1YDR040C 3276 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ADK1YDR226W 669 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 HPA3YEL066W 540 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YHR078WYHR078W 1659 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YAK1YJL141C 2424 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 TLC1TLC1 1301 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ECM21YBL101C 3354 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 MSS11YMR164C 2277 nt3.35□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 NAN1YPL126W 2691 nt3.34□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 RPS17BYDR447C 411 nt3.34□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 COX7YMR256C 183 nt3.34□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt3.34□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 VPS41YDR080W 2979 nt3.34□□□□□ -1.87
HRQ1Q05549 ITC1YGL133W 3795 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 ILS1YBL076C 3219 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 TAO3YIL129C 7131 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 RPS23AYGR118W 438 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 PSY1YKL076C 384 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YOP1YPR028W 543 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 snR51snR51 107 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YPL216WYPL216W 3309 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 ETP1YHL010C 1758 nt3.33□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 EXO84YBR102C 2262 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 COG3YER157W 2406 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.32□□□□□ -1.88
HRQ1Q05549 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 113.9 ms