Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNEQ04844 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms