Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CREMQ03060 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CREMQ03060 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CREMQ03060 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms