Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP4A11Q02928 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP4A11Q02928 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms