Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2BQ02880 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2BQ02880 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms