Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms