Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BEX3Q00994 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEX3Q00994 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms