Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms