Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HTRA4P83105 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HTRA4P83105 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms