Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCNA1P78396 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms