Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTA1P68133 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms