Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TPM4P67936 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TPM4P67936 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TPM4P67936 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TPM4P67936 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM4P67936 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms