Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms