Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOBP62745 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOBP62745 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms