Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNRPEP62304 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNRPEP62304 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms