Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP46P62068 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP46P62068 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP46P62068 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP46P62068 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP46P62068 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP46P62068 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP46P62068 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP46P62068 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP46P62068 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP46P62068 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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