Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVS71-1P61550 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVS71-1P61550 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms