Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCE1P61221 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCE1P61221 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms