Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN1P60606 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN1P60606 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms