Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA3P59666 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms