Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms