Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EEFSECP57772 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EEFSECP57772 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms